吉首市有1个乡、5个镇。是湖南省湘西土家族苗族自治州的地级行政区首府。市境东南部与泸溪县、西北部与花垣县、西南部与凤凰县、北部与保靖县和古丈县毗邻。吉首市境地貌以中低山和低山地貌为主，面积占吉首市面积的80%。
吉首市属中亚热带季风湿润性气候，兼具大陆性气候，四季分明，冬暖夏凉，春秋温和，冬长秋短。市辖6个街道、1个乡、5个镇。其中，吉首市下辖的1个乡、5个镇，分别为：
1、己略乡
己略乡，隶属于湖南省湘西土家族苗族自治州吉首市，地处吉首市西北部，东与马颈坳镇毗邻，南与峒河街道相连，西与矮寨镇接壤，北与保靖县夯沙乡交界，总面积78.99平方千米。己略乡下辖7个行政村，乡人民政府驻龙舞村。
己略乡，清代时期，己略乡境域属乾州厅四里。民国时期，分属镇溪乡、良章乡和中黄乡。年4月，社改乡，称己略乡。
2、太平镇
太平镇，隶属于湖南省湘西土家族苗族自治州吉首市，地处吉首市东部，西、南与河溪镇毗邻，北与马颈坳镇接壤，总面积.82平方千米。太平镇下辖11个行政村，镇人民政府驻太平村。
太平镇，清代时期，太平镇境域称四里。民国时期，属乾城县三区司马乡。年，建立太平公社。年4月，撤销人民公社，改制成立太平多人民政府。年，撤乡设镇。
3、丹青镇
丹青镇，隶属于湖南省湘西土家族苗族自治州吉首市，地处吉首市东北部，东与排绸乡交界，南与泸溪县毗邻，西与白岩乡、排吼乡相邻，北与古丈县接壤，总面积.32平方千米。丹青镇下辖1个社区、13个行政村，镇人民政府驻清明社区。
丹青镇，清代时期，丹青镇境域属二里。民国时期，属乾城县仙角乡、标锦乡。年8月，改为丹青镇。
4、河溪镇
河溪镇，隶属于湖南省湘西土家族苗族自治州吉首市，地处吉首市东南部，东南接泸溪县潭溪镇，西邻双塘镇，北抵吉首和太平乡，总面积.53平方千米。河溪镇下辖1个社区、9个行政村，镇人民政府驻河溪社区。
河溪镇，清朝时期，河溪镇境域属乾州厅，设河溪镇。民国三年（年），属乾城县。年4月，社改乡，称河溪镇。
5、矮寨镇
矮寨镇，隶属于湖南省湘西土家族苗族自治州吉首市，地处吉首市西部，东邻己略乡和保靖县夯沙乡，南接寨阳乡补点村，西靠凤凰县米良乡，北交花垣县排碧乡，总面积.27平方千米。矮寨镇下辖2个社区、17个行政村，镇人民政府驻矮寨社区。
矮寨镇，清朝时期，矮寨镇境域属乾州厅。民国时期，属乾城县。民国十一年（年），分设中阿乡、黄乐乡，后2乡合并为中黄乡。年，乾城县改名后属吉首县。年4月，社改乡，称矮寨乡，同年11月撤乡设镇，称矮寨镇。
6、马颈坳镇
马颈坳镇，隶属于湖南省湘西土家族苗族自治州吉首市，地处吉首市北部，北接白岩乡，南连峒河街道办事处、太平乡，西与己略乡接壤，西北与保靖县、古丈县相交，总面积.8平方千米。马颈坳镇下辖1个社区、20个行政村，镇人民政府驻溪马社区。
马颈坳镇，清代时期，马颈坳镇境域属三里。民国时期，分属东乡二区，良彰。年，社改乡，称马颈坳乡，同年改镇，称马颈坳镇。
此外，吉首市下辖的6个街道，分别为：峒河街道、乾州街道、镇溪街道、石家冲街道、双塘街道、吉凤街道。
